生化禁區 BIOMEGA 3

　　ＤＲＦ【技術文化遺產復興財團】從火星帶回來的【Ｎ５Ｓ病毒】所引起的〈怪物禍害〉擴散到整個地表。地表上，到處充斥著死了之後依然蠢蠢欲動的Ｎ５Ｓ病毒感染者…。

　　東亞重工的人造人庚 造一查出該計畫－－ＤＲＦ所執行的【人類總體改造計畫】－－的重點Ｎ５Ｓ病毒帶原者，伊恩．葛琳被囚禁的地方。他拒絕了同伴的制止，單槍匹馬潛入ＤＲＦ的下層組織公眾衛生局的根據地，【第三ＭＳＣＦ】。

　　但是ＤＲＦ總部比造一早一步攻擊了第三ＭＳＣＦ，開始壓制從公眾衛生局的將軍奈連以下的所有組織。對方使用了曾攻擊過跟造一同為情報員的壬　二銖的危險液體【逆相寫像重合體】，還朝著襲來，而親自指揮該行動的正是ＤＲＦ的總主尼爾迪本人！！

　　ＤＲＦ內部突然產生分裂。奈連、尼爾迪因為各自的想法使得戰局更加混沌不明。如今造一救回了伊恩，他能夠找出扭轉目前狀況的方法嗎！