GraphPad Prism學術圖表

本書主要介紹基於GraphPad Prism 9 的學術圖表繪製方法。本書以軟體所定義的8 種資料表為綱，按照“資料錄入—資料分析—圖表生成與美化”的順序，結合科研實例，使用t 檢驗、方差分析、生存分析和主成分分析等相關統計分析方法，介紹了散點圖、氣泡圖、柱狀圖、線圖、圓形圖、面積圖等常見學術圖表的繪製和美化方法。同時本書提煉了學術圖表繪製的一般流程、配色方法及GraphPad Prism 繪圖的進階技巧，兼顧學術圖表繪製的實用性和美觀性，適用於需要繪製學術圖表的高校學生和科研人員。

第1章 GraphPad Prism 快速入門 1
1.1 GraphPad Prism 簡介 1
1.2 GraphPad Prism 下載和安裝 2
1.3 GraphPad Prism 使用介面介紹 3
1.3.1 歡迎介面 3
1.3.2 操作介面 6
1.4 GraphPad Prism 圖形修飾和美化 17
1.4.1 圖形繪製區的修飾和美化 18
1.4.2 坐標軸區的修飾和美化 23
1.5 學術圖表配色知識 . 29
1.5.1 色彩三要素 30
1.5.2 色輪和色輪配色方法 32
1.5.3 色輪配色工具 36
1.6 GraphPad Prism 圖片匯出和發送 41
1.6.1 圖片匯出 41
1.6.2 圖片發送 43
1.7 GraphPad Prism 一般操作流程 44

第2章 GraphPad Prism 圖表與常見統計方法選擇 45
2.1 圖表分類及選擇 . 45
2.1.1 按照圖表外觀分類 45
2.1.2 按照圖表展示的資料關係分類 47
2.1.3 GraphPad Prism 自訂的8 種資料表 . 48
2.2 常見統計分析方法 . 51

第3章 XY 表及其圖形繪製 . 60
3.1 XY 表及其輸入介面 . 60
3.1.1 XY 表輸入介面 60
3.1.2 XY 表統計分析方法 63
3.1.3 XY 表下可繪製圖形 64
3.2 XY 表常見圖形繪製 . 65
3.2.1 散點圖 65
3.2.2 象限散點圖 71
3.2.3 火山圖 74
3.2.4 克利夫蘭點圖、棒棒糖圖 84
3.2.5 模擬長條圖 86
3.2.6 線條連接的散點圖 88
3.2.7 雙Y 軸圖形 95
3.2.8 折線圖和曲線圖 100
3.2.9 圖形平移：瀑布圖 104
3.2.10 坐標軸平移和波動中心軸設置 106
3.2.11 非連續X 值繪圖 109
3.2.12 面積圖 110
3.3 帶統計分析的XY 表圖形繪製 114
3.3.1 相關分析 115
3.3.2 簡單線性回歸 118
3.3.3 非線性回歸 123
3.3.4 帶置信條帶的散點圖 132

第4章 縱清單（Column）及其圖形繪製 . 135
4.1 縱清單及其輸入介面 . 135
4.1.1 縱清單輸入介面 135
4.1.2 縱列表統計分析方法 137
4.1.3 縱清單下可繪製圖形 137
4.2 縱清單常見圖形繪製 . 141
4.2.1 簡單柱狀圖/橫條圖 . 141
4.2.2 截斷柱狀圖 147
4.2.3 長條圖 150
4.2.4 手動分組分割 153
4.2.5 懸浮橫條圖 155
4.2.6 森林圖 157
4.3 帶統計分析的縱清單圖形繪製 . 163
4.3.1 單樣本t 檢驗 . 163
4.3.2 成組t 檢驗——單資料數列柱狀圖 . 164
4.3.3 配對t 檢驗 . 171
4.3.4 普通單因素方差分析 174
4.3.5 隨機區組設計單因素方差分析 182
4.3.6 重複測量單因素方差分析 187
4.3.7 ROC 曲線繪製 . 190
4.3.8 Bland-Altman 圖 . 196

第5章 行列分組表（Grouped）及其圖形繪製 . 200
5.1 行列分組表及其輸入介面 . 200
5.1.1 行列分組表輸入介面 200
5.1.2 行列分組表統計分析方法 201
5.1.3 行列分組表下可繪製圖形 202
5.2 行列分組表常見圖形繪製 . 205
5.2.1 交錯和分隔柱狀圖 205
5.2.2 堆積柱狀圖 211
5.2.3 雙向柱狀圖 216
5.2.4 疊印柱狀圖 221
5.2.5 熱圖 224
5.3 帶統計分析的行列分組表圖形繪製 . 231
5.3.1 二因素方差分析 231
5.3.2 三因素方差分析 237

第6章 列聯表（Contingency）及其圖形繪製 . 238
6.1 列聯表及其輸入介面 . 238
6.2 帶統計分析的列聯表圖形繪製 . 239
第7 章 生存表（Survival）及生存曲線繪製 . 244
7.1 生存曲線和生存表簡介 . 244
7.2 傳統K-M 生存曲線繪製 247
7.3 基因表達K-M 生存曲線繪製 251

第8章 其他資料表及其圖形繪製 . 256
8.1 局部整體表（Parts of whole）及其圖形繪製 256
8.2 多變數表（Multiple variables）及其圖形繪製 260
8.2.1 氣泡圖繪製 262
8.2.2 主成分分析 265
8.3 巢狀表格（Nested）及其圖形繪製 270

第9章 GraphPad Prism 繪圖進階技巧 275
9.1 首選項設置 . 275
9.2 圖形組合 . 278
9.2.1 圖中圖 278
9.2.2 圖形堆疊：帶箱線圖的前後圖等 281
9.2.3 圖形拼接：邊際圖 285
9.3 自訂配色方案 . 291
9.4 風格一致快速繪圖：魔棒工具和克隆 . 296
9.4.1 魔棒工具 296
9.4.2 克隆和範本 300
參考文獻 304

張敏，生物學博士，公眾號“如圖所示”主創。擁有多年科研繪圖經驗，錄製有《PPT科研作圖》《零基礎玩轉Illustrator科研繪圖》《Photoshop科研點陣圖全攻略》和《實用SCI論文圖表繪製》等網路課程，翻譯有Adobe官方教程《Adobe Illustrator CC2019經典教程》。