鐮倉與室町時代：武士集團的崛起

1199年，源賴朝去世。源賴朝死後，幕府政權被他的妻子北條政子和岳父北條時政掌握。自此幕府政權中將軍成了擺設，實權則被北條氏世襲的執權所領導。1219年，唆使源賴家遺子源公曉暗殺源實朝，隨後借此殺害源公曉，源氏家族絕嗣，成為統治者，並擁立與源氏有血緣關係的為將軍。1221年，后鳥羽上皇策動倒幕戰爭，史稱“承久之亂”，但以失敗告終。


承久之亂后，公家政權開始衰落，武士階層得到了發展。但是鐮倉幕府的穩定沒有維持多久，中日兩國的元日戰爭加速了鐮倉幕府的衰退與覆滅，並加深了公家與武家的裂痕。1318年，即位，決心恢復皇室權威，廢黜院政，開始親征。1331年，后醍醐天皇再次密謀倒幕，后被幕府軍打敗，史稱“”，后醍醐天皇被流放，第二次倒幕運動失敗。1333年，各地豪族都開始倒幕，幕府派足利高氏前去平亂，足利高氏早已不滿北條氏專制政權，途中倒戈，攻下了鐮倉，最後一代執權天皇，鐮倉幕府滅亡。后醍醐天皇退位后敗走吉野，日本進入南北朝時期。


公元1336年，足利高氏建立政權，是最早的室町幕府。室町幕府直到第三代將軍足利義滿的時候才逐漸穩定下來。1392年，足利義滿統一南北朝。足利義滿重視對於寺社和地方守護的打壓，對過於強大的地方勢力給予嚴厲的壓制。這一定程度上減弱了幕府的外部威脅，但並不能阻止內部隱患的產生。1467年，圍繞將軍繼承問題，細川氏與山名氏兩大派系的朋黨傾軋達到了巔峰，最後直接訴諸武力，史稱“應仁之亂”。“應仁之亂”后，各地大名看準了這個能夠成為“天下人”的契機紛紛起兵，意圖在亂世中一展身手，戰國時代來臨了。