網絡藥理學導論 - 城邦阅读花园






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	目錄第1章網路靶標理論與網路藥理學 1.1網路藥理學：下一代藥物研究模式 1.2中醫藥在網路藥理學起源和發展中的關鍵作用 1.3網路藥理學核心理論：網路靶標 1.3.1網路靶標理論的提出與發展 1.3.2網路靶標的概念 1.4網路藥理學研究模式和特點概述 1.4.1“單靶標局部對抗”研究模式 1.4.2“網路靶標系統調節”研究模式 1.4.3網路藥理學分析典型場景 1.4.4網路藥理學研究特點、挑戰及發展方向參考文獻第2章基於人工智慧演算法的網路藥理學在藥物研發中的應用 2.1運用於網路藥理學的人工智慧方法介紹 2.1.1人工智慧演算法簡介 2.1.2人工智慧演算法性能評價方法 2.1.3人工智慧方法應用條件 2.1.4人工智慧方法的前沿和展望 2.2人工智慧在網路藥理學研究中的應用 2.2.1藥物靶點的預測和發現 2.2.2藥物作用機制的研究 2.2.3藥物新用途的發現 2.2.4中藥物質基礎與中醫治療理論的研究 2.3人工智慧方法的應用展望參考文獻第3章網路藥理學常用資料庫 3.1網路藥理學常用中醫藥資料庫 3.1.1ETCM：中醫藥百科全書 3.1.2SymMap：關注證候關聯的中醫藥整合資料庫 3.1.3BATMANTCM：中藥分子機制的生物資訊學分析平臺 3.1.4TCMID：用於中藥分子機制分析的中醫藥整合資料庫 3.1.5其他中醫藥資料庫 3.2網路藥理學常用生物相關資料庫 3.2.1OMIM：人類孟德爾遺傳病線上資料庫 3.2.2HPO：人類表型本體資料庫 3.2.3DisGeNET：疾病基因關聯資料庫 3.2.4MalaCards：疾病資訊資料庫 3.3網路藥理學常用靶標相關資料庫 3.3.1TTD：治療靶標資料庫 3.3.2PDB：蛋白質晶體結構資料庫 3.3.3GeneCards：基因資訊資料庫 3.3.4KEGG：京都基因與基因組百科全書 3.4網路藥理學常用蛋白相互作用資料庫 3.4.1BioGRID：生物學通用相互作用資料庫 3.4.2DIP：蛋白質相互作用資料庫 3.4.3IntAct：分子相互作用資料庫 3.4.4STRING：基因/蛋白相互作用關聯式資料庫參考文獻第4章網路藥理學常用軟體 4.1網路藥理學軟體功能框架及分類 4.1.1總體軟體功能需求 4.1.2網路藥理學軟體功能框架及分類 4.2網路藥理學常用的Web軟體 4.2.1藥物靶標預測Web軟體 4.2.2藥物適應症分析Web軟體 4.2.3基因功能富集分析Web軟體 4.2.4蛋白相互作用網路構建Web軟體 4.3基於圖形化介面操作的軟體 4.3.1差異基因富集分析軟體 4.3.2網路分析軟體 4.4基於程式設計語言的工具包 4.4.1C 、Java工具包的使用 4.4.2Python、R工具包的使用參考文獻第5章網路藥理學和中醫藥現代化研究案例 5.1網路藥理學與中醫證候研究案例 5.1.1寒、熱證候及對證方劑的網路藥理學研究案例分析 5.1.2慢性乙型肝炎致肝纖維化的“同病異證”研究案例分析 5.2網路藥理學與中藥方劑研究案例 5.3網路藥理學與中藥創制研究案例 5.4網路藥理學與民族藥研究案例參考文獻第6章網路藥理學與現代藥物研發案例 6.1複雜疾病內在機制和干預靶標 6.2藥物系統性作用機制 6.3多靶標藥物研發 6.3.1缺血性中風：從單一藥物靶標到協同的網路藥理學 6.3.2聯合網路藥理學與表型篩選開發新的止痛類藥物 6.4藥物重新定位 6.4.1基於網路的藥物重定位預測及基於人群的驗證 6.4.2基於網路藥理學的藥物重定位發現新的抗抑鬱藥物 6.5組合藥物研發參考文獻第7章基於藥物的網路藥理學實踐流程 7.1尋找單味中藥或方劑的有效成分 7.1.1資料獲取與處理 7.1.2網路構建與視覺化 7.1.3網路分析與預測 7.1.4驗證與總結 7.2闡述單味中藥或方劑的藥效機制 7.2.1資料獲取與處理 7.2.2網路構建與視覺化 7.2.3網路分析與預測 7.2.4驗證與總結 7.3詮釋中藥配伍理論的科學內涵 7.3.1資料獲取與處理 7.3.2網路構建與視覺化 7.3.3網路分析與預測 7.3.4驗證與總結 7.4解釋中藥與西藥之間的相互作用 7.4.1資料獲取與處理 7.4.2網路構建與視覺化 7.4.3網路分析與預測 7.4.4驗證與總結 7.5藥物臨床應用的重定位——中藥成分保護腦缺血再灌注損傷的新用途 7.5.1資料獲取與處理 7.5.2網路構建與視覺化 7.5.3網路分析與預測 7.5.4驗證與總結 7.6多靶點藥物的開發——中藥配伍保護低密度脂蛋白誘導的內皮細胞損傷 7.6.1資料獲取與處理 7.6.2網路構建與視覺化 7.6.3網路分析與預測 7.6.4驗證與總結參考文獻第8章基於疾病的網路藥理學實踐流程 8.1冠心病疾病網路構建及分析 8.1.1資料獲取與處理 8.1.2網路構建與視覺化 8.1.3網路分析與預測 8.1.4驗證與總結 8.2疾病網路用於中藥方劑的研究實踐 8.2.1中藥方劑的整合作用機制研究 8.2.2中藥方劑的“君臣佐使”配伍規律研究 8.2.3中藥方劑的“益氣、活血”功效研究參考文獻第9章基於藥物疾病的網路藥理學實踐流程 9.1化橘紅治療呼吸系統疾病的網路藥理學研究 9.1.1化橘紅治療呼吸系統疾病的作用靶點預測 9.1.2化橘紅治療呼吸系統疾病的作用靶點驗證 9.1.3化橘紅治療呼吸系統疾病的調控網路分析 9.2丹紅注射液治療心血管疾病的網路藥理學研究 9.2.1丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點預測 9.2.2丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點驗證 9.2.3丹紅注射液治療心血管疾病的調控網路分析參考文獻附錄A網路藥理學評價方法指南附錄B網路藥理學評價要素與評價指標附錄C網路藥理學研究報告示例後記