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第一章:準備工作 1.1 從採購新電腦談起 1.2 運算伺服器的設定 1.3 建立遠端連線 第二章:基本Linux指令介紹 2.1 沒有要你當Linux專家 2.2 資料夾的操作 2.3 檔案的操作 2.4 權限的指派分配 2.5 了解系統狀態的相關指令 2.6 其他實用指令介紹 第三章:序列品質檢查 3.1 淺談高通量定序 3.2 高通量定序的先天問題 3.3 關於品質分數的標準 3.4 實戰品質校驗 第四章:序列比對 4.1 序列比對的意義 4.2 選擇序列比對工具 4.3 序列比對的實際操作 4.4 序列比對結果轉檔 4.5 使用基因體瀏覽器 第五章:繪圖卡輔助運算 5.1 繪圖卡的計算優勢 5.2 繪圖卡運算的業界標準與使用 5.3 生物資訊的實際應用 5.4 成效有限的理由 第六章:研究流程建立 6.1 實現計算全自動 6.2 編寫腳本語言 6.3 測試與除錯 6.4 實作案例分享 6.5 常見失敗案例分析 第七章:雲端圖型化 7.1 淺談雲端架構 7.2 Amazon雲端平台 7.3 開放式生物計算雲端平台 7.4 安裝與設定自己的Galaxy伺服器 附錄A:研究生入門:準備期刊文獻報告 附錄B:生物資訊研究相關文獻檢索 附錄C:簡單的資料處理實務
作者簡介 李鎮宇(Eric Lee) 一個在求學階段從第一類組到三類組都經歷過的資訊工作者。熱愛寫作閱讀、旅遊還有最新科技。喜歡用文字分享心得,讓知識與經驗得以傳承。寫作題材涉及科技、旅遊、生命科學、社會觀察等領域,常讓人摸不透他的特長為何。用心生活,期許自身的專業可以幫助他人。現旅居海外,為資訊相關領域從業人員。
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