化學信息學

《化學資訊學》從實用性角度出發，按化學資訊的獲取、化學資訊的分析加工以及化學資訊的傳播精心設計教學內容，主要包括：電腦及網路技術、科學資料庫及文獻檢索、電腦化學圖文處理技術、電腦輔助分子設計、電腦輔助教學等方面的知識與應用。本書是一部連接MOOC與課堂的新形態教材，配套了豐富的視頻資源，讀者可以通過手機掃描二維碼來觀看，也可以配合中國大學慕課網站上的線上課程《化學資訊學》使用。

《化學資訊學》可供普通高校化學類專業學生使用，也可供廣大的科技工作者參考。

第1章化學資訊學導論 1
1.1分子結構與性質的數值化表述及資料收集 1
1.2圖論與概率論在分子結構資訊中的應用 4
1.3數學建模與資訊轉化 7
1.3.1甄選輸入變數 7
1.3.2資料收集 8
1.3.3數值模型的參數訓練與測試 8
1.4受體-配體打分函數模型——從經驗化模型到人工神經網路 9
1.4.1主成分分析 10
1.4.2人工神經網路 10

第2章文獻檢索概論 13
2.1 資訊、知識、情報和文獻 13
2.2科技文獻的級別 14
2.3科技文獻類型 15
2.4科技文獻的出版形式及科技文獻的特點 17
2.4.1科技文獻的出版形式 17
2.4.2科技文獻的特點 17
2.5科技文獻檢索概述 18
2.5.1科技文獻檢索的含義 18
2.5.2文獻的存儲與檢索 18
2.5.3科技文獻檢索的意義與作用 19
2.5.4科技文獻檢索工具 19
2.6科技文獻檢索的途徑 20
2.6.1根據文獻的外部特徵進行檢索 20
2.6.2根據文獻的內容特徵進行檢索 21
2.7科技文獻的檢索方法 21
2.7.1常規法 21
2.7.2追溯法 22
2.7.3迴圈法（綜合法） 22
2.7.4基本檢索步驟 23

第3章化學資料庫 24
3.1全文文獻資料庫 25
3.1.1全文資料庫簡介 25
3.1.2重要中文全文資料庫 25
3.1.3重要英文全文資料庫 28
3.2文摘索引資料庫 32
3.2.1文摘索引資料庫簡介 32
3.2.2文摘索引資料庫發展趨勢及意義 33
3.2.3重要外文文摘索引資料庫 33
3.2.4Web of Science（SCI）資料庫的介紹與使用 35
3.2.5SciFinder（CAS）資料庫的介紹與使用 36
3.2.6X-MOL知識平臺 41
3.3特種文獻資料庫 54
3.3.1專利文獻資源與檢索 54
3.3.2學位論文資源與檢索 55
3.3.3化學事實資料庫 55

第4章化學軟體簡介與ChemBioOffice使用 57
4.1化學軟體概述 57
4.2化學結構視覺化軟體 58
4.2.1二維化學結構式繪製軟體 58
4.2.2化學三維結構繪製軟體 59
4.3資料處理軟體 59
4.4文獻管理軟體 60
4.5圖譜解析軟體 61
4.6化學計算軟體 61
4.7其他軟體 62
4.8ChemBioOffice軟體 62
4.8.1ChemDraw的使用方法 62
4.8.2ChemDraw的其他功能 68
4.8.3分子模型軟體Chem3D 70

第5章科學資料處理軟體 80
5.1資料分析軟體Origin概述 80
5.2Origin介面簡介 81
5.2.1Origin常用術語 81
5.2.2Origin菜單介紹 82
5.3Origin的基本使用 83
5.3.1數據導入 83
5.3.2數據作圖 85
5.3.3繪製工作曲線 88
5.3.4區域性擬合 90
5.3.5非線性擬合 92
5.3.6疊圖與多Y軸圖的繪製 95
5.3.7多屏圖的繪製 97

第6章圖片處理軟體Photoshop 100
6.1科技作圖 100
6.1.1科技論文中的圖片 100
6.1.2科技論文圖表規範 101
6.2繪圖基本概念 102
6.3Photoshop簡介 105
6.3.1Photoshop介面簡介 105
6.3.2Photoshop基本概念 107
6.3.3Photoshop常用功能 108
6.3.4細胞膜模型的繪製 111
6.3.5組圖的繪製 113
6.3.6透視色譜圖 115
6.3.7電鏡圖上色 118

第7章Adobe Illustrator科研繪圖 121
7.1Illustrator介面介紹 121
7.1.1功能表列 122
7.1.2工具箱 122
7.1.3工具屬性欄 123
7.1.4面板 123
7.2Illustrator基本概念和常用功能 123
7.2.1路徑和錨點 123
7.2.2圖層 125
7.2.3畫筆 126
7.2.4符號 126
7.3Illustrator 基礎操作 126
7.3.1填色和描邊 126
7.3.2物件的基本操作方法 129
7.3.3路徑查找器 129
7.3.4形狀生成器和即時上色工具 131
7.3.5混合工具 133
7.3.6效果濾鏡 134
7.4Illustrator實例繪製 134
7.4.1實例1——模式圖 134
7.4.2實例2——小腸絨毛細胞 145

第8章核磁共振譜圖解析軟體ACD/NMR與文獻管理軟體EndNote 156
8.1ACD/NMR軟體介紹 156
8.1.1ACD/NMR Processor的主要功能 157
8.1.2ACD/NMR Processor的使用簡介 157
8.2文獻的引用 163
8.2.1文獻的規範化引用 163
8.2.2引用文獻的意義 164
8.2.3引用文獻注意事項 165
8.3文獻管理工具EndNote 165
8.3.1EndNote簡介 165
8.3.2EndNote的文獻導入與檢索 167
8.3.3使用EndNote插入參考文獻 168

第9章學位論文排版 171
9.1文檔的新建與保存 172
9.2頁面設置 173
9.2.1頁面配置設置 174
9.2.2目錄的生成 177
9.2.3分節符號 178
9.2.4頁眉、頁腳、頁碼的設置 179
9.3樣式的使用 182
9.3.1樣式的創建 182
9.3.2章節標題的設置與多級列表的使用 184
9.3.3更新目錄 194
9.3.4圖表的題注和交叉引用 196
9.3.5公式的題注和交叉引用 200
9.4參考文獻 204
9.4.1著錄項目和著錄格式 204
9.4.2利用EndNote插入參考文獻 205
9.5常用的小技巧匯總 205
9.5.1快速定位功能窗格 205
9.5.2三線表的畫法 206
9.5.3快速鍵 208
參考文獻 210